第一、寻找便秘原因：对母乳喂养的婴儿很难得知母乳量是否足够，如果婴儿体重增加不理想，食后啼哭或一直咬着奶头不放，就可以考虑是母乳量不足，必须增加牛奶以补足。
第二、调整食物结构：因牛奶喂养不当造成的便秘，可减少奶量，增加糖量，即把牛奶的含糖量由原来的5%～8%增加到10%～12%，并适当增加果汁。不满3～4个月的婴儿，可在牛奶中加一些奶糕，奶糕中的碳水化合物在肠道内部分发酵后，可刺激肠蠕动，有助于通便。4～5个月以上的婴儿，可适当增加辅食，最好将菠菜、卷心菜、青菜、芥菜等切碎，放人米粥内同煮，做成各种美味的菜粥吃。
第三、正确添加辅食：婴儿在接受新的食品时，容易出现便秘，家长们给小儿添加辅食一定要遵循由一种到多种，由少到多的原则。以婴儿营养米粉为例，3～4个月的小儿，刚开始时喂1～2汤匙即可，2周以后再增加至4～5匙。冲调米粉时，要注意米粉和水的比例，避免比例不当造成大便干燥。4～5个月的婴儿，适当喂哺蔬菜泥及果泥等含纤维素的食物，可防止便秘。对较大者，可加服些如橘子汁、蜂蜜糖水等滑肠食物，要多吃些水果和含纤维素较多的蔬菜如芹菜、韭菜及粥类食物。
第四、训练排便习惯：从3～4个月起，有意识地训练婴儿养成食后排便习惯。因进食后肠蠕动加快，常会出现便意，故一般宜选择在进食后让孩子排便，建立起排便条件反射，就能起到事半功倍的效果。从3个月开始，可有规律地在早晨喂奶后让婴儿坐盆，同时要注意环境温度，便盆要使婴儿感到舒适。
第五、合理使用药物：婴儿便秘经以上方法处理仍不见效者，可以适当使用开塞露或缓泻剂通便。开塞露主要含有甘油和山梨醇，能刺激肠管蠕动起到通便作用。使用时，要注意开塞露注入肛门内以后，家长应用手将婴儿两侧臀部夹紧，让开塞露液体在肠内保留一会儿，再让孩子排便，效果就会更好。
在一般情况下，婴儿便秘的治疗跟成年人的治疗措施有些相似，不过如果涉及到治疗的问题，建议还是到正规专业的儿童医院进行治疗，以确保对婴儿身体的治疗安全。